很多病毒在刚启动时，在内在中是不可见的，而系统也会误认为他们是合法的程序而加以保护，这就造成了病毒无法清除；
在DOS模式下，连windows都没有启动，病毒就更不可能运行，因此这时查杀，就能绕过系统保护，达到干净杀毒的目的；
1 利用启动光盘或DOS工具箱进入DOS；
2 输入杀毒程序的路径后按Enter即可快速对系统进行杀毒；
杀毒1(在打开IE时，在IE界面的左下框里提示：正在打开网页，但老半天没响应)
在任务管理器里查看进程，（进入方法，把鼠标放在任务栏上，按右键—任务管理器—进程）看看CPU的占用率如何，如果是100%，可以肯定，是感染了病毒，这时你想运行其他程序简直就是受罪。这就要查查是哪个进程贪婪地占用了CPU资源．找到后，最好把名称记录下来，然后点击结束，如果不能结束，则要启动到安全模式下把该东东删除，还要进入注册表里，（方法：开始—运行，输入regedit）在注册表对话框里，点编辑—查找，输入那个程序名，找到后，点鼠标右键删除，然后再进行几次的搜索，往往能彻底删除干净。
今天在这里为大家提供两则小技巧，以便帮你强行杀死顽固病毒进程。
根据进程名查杀
这种方法是通过WinXP系统下的taskkill命令来实现的，在使用该方法之前，首先需要打开系统的进程列表界面，找到病毒进程所对应的具体进程名。
接着依次单击“开始→运行”命令，在弹出的系统运行框中，运行“cmd”命令；再在DOS命令行中输入“taskkill/imaaa”格式的字符串命令，单击回车键后，顽固的病毒进程“aaa”就被强行杀死了。比方说，要强行杀死“conime。exe”病毒进程，只要在命令提示符下执行“taskkill/imconime。exe”命令，要不了多久，系统就会自动返回结果。
根据进程号查杀
上面的方法，只对部分病毒进程有效，遇到一些更“顽固”的病毒进程，可能就无济于事了。此时你可以通过Win2000以上系统的内置命令——ntsd，来强行杀死一切病毒进程，因为该命令除System进程、SMSS。EXE进程、CSRSS不能“对付”外，基本可以对付其它一切进程。但是在使用该命令杀死病毒进程之前，需要先查找到对应病毒进程的具体进程号。
考虑到系统进程列表界面在默认状态下，是不显示具体进程号的，因此你可以首先打开系统任务管理器窗口，再单击“查看”菜单项下面的“选择列”命令，在弹出的设置框中，将“PID(进程标志符)”选项选中，单击“确定”按钮。返回到系统进程列表页面中后，你就能查看到对应病毒进程的具体PID了。
接着打开系统运行对话框，在其中运行“cmd”命令，在命令提示符状态下输入“ntsd-cq-pPID”命令，就可以强行将指定PID的病毒进程杀死了。例如，发现某个病毒进程的PID为“444”，那么可以执行“ntsd-cq-p444”命令，来杀死这个病毒进程。
Windows任务管理器是大家对进程进行管理的主要工具，在它的“进程”选项卡中能查看当前系统进程信息。在默认设置下，一般只能看到映像名称、用户名、CPU占用、内存使用等几项，而更多如I/O读写、虚拟内存大小等信息却被隐藏了起来。可别小看了这些被隐藏的信息，当系统出现莫名其妙的故障时，没准就能从它们中间找出突破口。
1.查杀会自动消失的双进程木马
前段时间朋友的电脑中了某木马，通过任务管理器查出该木马进程为“system.exe”，终止它后再刷新，它又会复活。进入安全模式把c:＼windows＼system32＼system.exe删除，重启后它又会重新加载，怎么也无法彻底清除它。从此现象来看，朋友中的应该是双进程木马。这种木马有监护进程，会定时进行扫描，一旦发现被监护的进程遭到查杀就会复活它。而且现在很多双进程木马互为监视，互相复活。因此查杀的关键是找到这“互相依靠”的两个木马文件。借助任务管理器的PID标识可以找到木马进程。
调出Windows任务管理器，首先在“查看→选择列”中勾选“PID（进程标识符）”，这样返回任务管理器窗口后可以看到每一个进程的PID标识。这样当我们终止一个进程，它再生后通过PID标识就可以找到再生它的父进程。启动命令提示符窗口，执行“taskkill /im system.exe /f”命令。刷新一下电脑后重新输入上述命令，可以看到这次终止的system.exe进程的PID为1536，它属于PID为676的某个进程。也就是说PID为1536的system.exe进程是由PID为676的进程创建的。返回任务管理器，通过查询进程PID得知它就是“internet.exe”进程。
找到了元凶就好办了，现在重新启动系统进入安全模式，使用搜索功能找到木马文件c:＼windows＼internet.exe ，然后将它们删除即可。前面无法删除system.exe，主要是由于没有找到internet.exe（且没有删除其启动键值），导致重新进入系统后internet.exe复活木马。
2.揪出狂写硬盘的P2P程序
单位一电脑一开机上网就发现硬盘灯一直闪个不停，硬盘狂旋转。显然是本机有什么程序正在进行数据的读取，但是反复杀毒也没发现病毒、木马等恶意程序。
打开该电脑并上网，按Ctrl+Alt+Del键启动了任务管理器，切换到“进程”选项卡，点击菜单命令“查看→选择列”，同时勾选上“I/O写入”和“I/O写入字节”两项。确定后返回任务管理器，发现一个陌生的进程hidel.exe，虽然它占用的CPU和内存并不是特别大，但是I/O的写入量却大得惊人，看来就是它在捣鬼了，赶紧右击它并选择“结束进程”终止，果然硬盘读写恢复正常了。
1 检测注册表的run,runservices等项的分支，如冰河木马，会在run分支内新建路径："c:\windows|system\Kernel32.exe"路径，一般指向winnt,system,system32等文件夹下的一些.exe,.com或.bat文件；
2 local_machine和current user\software\microsoft\internetexporer\main中的分支，如果被修改，改回；
3 检查classes_root的exefile和txtfile\shell\open\command分支等几个常用文件类型的默认打开程序是否被更改？
4 重新启动到ms-dos，删除上述注册表指向路径的文件；
1 清除aol Trojan木马
打开win.ini文件在[windows]下面"run="和"load="都加载了特洛伊木马程序的路径，将其清除后保存；
2 Doly v1.7木马
在c:\autoexec.bat文件中加入了如下语句，
要删除@echo off copy c:\sys.lon c:\windows\startmenu\startup item\
del c:\win.reg
3 木马v2.1-2.1 gold
在system.ini中的shell=explore.exe msrexe.exe更改为shell=explorer.exe
木马会在注册表中添加一些分支，或进行一些修改，可能有多个地方被更改，最好的选择是备份注册表，然后导入、替代；